中文Jaunais Dienvidāfrikas koronavīrusa variants 501Y-V2
2020. gada 18. decembrī Dienvidāfrika atklāja jaunā koronavīrusa 501Y-V2 mutantu.Tagad Dienvidāfrikas mutants ir izplatījies vairāk nekā 20 valstīs.Eksperimenti ir parādījuši, ka virs jaunā koronavīrusa mutantiem var būt citi K417N/T, E484K un N501Y jaunā koronavīrusa varianti, kas var samazināt vakcīnas izraisīto plazmu neitralizējošo antivielu neitralizēšanas spēju.Tomēr, salīdzinot ar atsauces genomu Wuh01 (secības numurs MN908947), Dienvidāfrikas mutanta genoma sekvences 501Y.V2 ir 23 nukleotīdu varianti.Tam ir tāda pati N501Y mutācija kā Lielbritānijas mutanta B.1.1.7 apakštipam, taču tajā joprojām ir mutācijas divās galvenajās S proteīna vietās E484K un K417N, kurām ir potenciāli nozīmīga ietekme uz vīrusa spēju inficēties.
Jaunais koronavīruss ir vienpavedienu RNS vīruss, kura genoma mutācijas ir biežākas.Viena mērķa noteikšana var viegli novest pie tā, ka paraugi ar zemu vīrusu slodzi un mutētiem vīrusu celmiem netiek atklāti.Atkārtotas pārbaudes biežums vienā pozitīvajā mērķa noteikšanā var sasniegt vairāk nekā 10%, kas var palielināt darba slodzi un pagarināt diagnostikas laiku.Vairāku mērķu noteikšana un katra mērķa rezultātu savstarpēja pārbaude var palielināt noteikšanas ātrumu un atvieglot agrīnu diagnostiku.
1. attēls. Jaunā koronavīrusa infekcijas mehānisma shematiskā diagramma
Lielbritānijas jaunais koronavīrusa mutants B.1.1.7
2020. gada 26. decembrī tiešsaistē tika publicēts pirmais zinātniskais raksts par B.1.1.7 celmu.Londonas Higiēnas universitātes Apvienotās Karalistes un Tropisko slimību institūts apstiprināja, ka B.1.1.7 celms spēj izplatīties vairāk nekā citi celmi, kas bija vairāk nekā 56% (95% TI 50–74%).Tā kā šim jaunajam mutanta celmam ir acīmredzamāka pārraides jauda, ir kļuvis grūtāk kontrolēt COVID-19.Nākamajā dienā Birmingemas Universitāte Apvienotajā Karalistē augšupielādēja rakstu par MedRxiv.Pētījumā konstatēts, ka ORF1ab un N vīrusa gēnu kopiju skaits pacientiem, kas inficēti ar B.1.1.7 mutantu celmu (S-gēna atbirums), ievērojami palielinājās;šī parādība tika novērota populācijā.Šajā rakstā norādīts, ka pacientiem, kas inficēti ar Lielbritānijas mutantu B.1.1.7, ir ievērojami lielāka vīrusu slodze, tāpēc šis mutants var būt arī patogēnāks.
2. attēls. Genoma mutāciju secība, kas ietverta Lielbritānijas koronavīrusa mutanta celmā B.1.1.7.
3. attēls. N501Y mutācija notika gan Lielbritānijā, gan DienvidāfrikāVarianti
Jaunu koronavīrusa variantu noteikšanas komplekts
Chuangkun Biotech Inc. ir veiksmīgi izstrādājis noteikšanas komplektu B.1.1.7 un 501Y-V2 jauniem koronavīrusa variantiem.
Šī produkta priekšrocības: augsta jutība, vienlaicīga 4 mērķu noteikšana, kas aptver B.1.1.7 mutanta celma un 501Y.V2 Dienvidāfrikas mutanta celma galvenās mutācijas vietas.Šis komplekts var vienlaicīgi noteikt N501Y, HV69-70del, E484K mutāciju vietas un jauno koronavīrusa S gēnu;Ātrā pārbaude: no parauga ņemšanas līdz rezultātam paiet tikai 1 stunda 30 minūtes.
4. attēls. COVID-19 Lielbritānijas varianta pastiprināšanas līknes noteikšana
5. attēls. Covid-19 Dienvidāfrikas variantu pastiprināšanas līknes noteikšana
6. attēls. Jaunā koronavīrusa amplifikācijas līknes savvaļas tips
Nav skaidrs, kā šīs mutācijas uzkrāj jaunu COVID-19 pandēmijas ilgtermiņa ietekmi.Taču tas mums atgādina, ka šīs mutācijas var ietekmēt dabiskās imunitātes un vakcinācijas radītās imunitātes efektivitāti.Tas arī atgādina, ka mums ilgstoši ir nepārtraukti jāuzrauga jaunais koronavīruss un jāatjaunina Covid-19 vakcīna, lai tiktu galā ar jaunā koronavīrusa attīstību.
Izlikšanas laiks: 12.03.2021