中文Jauns koronavīrusa varianta celms 501Y-V2 Dienvidāfrikā
2020. gada 18. decembrī Dienvidāfrika atklāja jaunā koronavīrusa 501y-v2 mutantu.Tagad Dienvidāfrikas mutants ir izplatījies vairāk nekā 20 valstīs.Eksperimenti ir parādījuši, ka virs jaunajiem Corona-vīrusa mutantiem var būt citi jauni K417N/T, E484K un N501Y mutāciju koronavīrusu varianti, kas var samazināt vakcīnas izraisīto plazmas neitralizējošo antivielu neitralizējošo spēju.Tomēr, salīdzinot ar atsauces genomu WUH01 (secības numurs MN908947), Dienvidāfrikas mutantu genoma secības 501y.v2 ir 23 nukleotīdu varianti.Tam ir tāda pati N501Y mutācija kā Lielbritānijas mutantam B.1.1.7. Subtipe, taču tā joprojām satur mutācijas divās galvenajās vietnēs E484K un K417N no S olbaltumvielām, kurām ir potenciāli svarīga ietekme uz vīrusa spēju inficēt.
Jaunais koronavīruss ir vienpavediena RNS vīruss, kas genoma mutācijas ir biežākas.Vienreizēja mērķa noteikšana var viegli izraisīt izlaišanu paraugu noteikšanai ar zemu vīrusu slodzi un mutētiem vīrusa celmiem.Vairāku mērķu noteikšana un katra mērķa rezultātu savstarpēja pārbaude var palielināt noteikšanas ātrumu un atvieglot agrīnu diagnozi.
1. attēls. Jaunā koronavīrusu infekcijas mehānisma shematiska diagramma
Lielbritānijas jaunais koronavīrusa mutants B.1.1.7
2020. gada 26. decembrī tiešsaistē tika publicēts pirmais B.1.1.7 celma zinātniskais dokuments.Londonas Higiēnas Universitātes UK un tropisko slimību institūts apstiprināja, ka B.1.1,7 celms ir vairāk spējīgs izplatīties nekā citi celmi, kas bija vairāk nekā 56% (95% TI 50–74%).Tā kā šim jaunajam mutanta celmam ir acīmredzamāka pārraides jauda, ir kļuvis grūtāk kontrolēt COVID-19.Nākamajā dienā Birmingemas universitāte Apvienotajā Karalistē augšupielādēja rakstu par Medrxiv.Pētījumā tika atklāts, ka ORF1AB un N vīrusa gēnu kopiju skaits pacientiem, kas inficēti ar B.1.1,7 mutanta celmu (S-gēna pamešana), ir ievērojami palielināts;Šajā rakstā norādīts, ka pacientiem, kas inficēti ar Lielbritānijas B.1.1.7. Mutantam, ir ievērojami lielāka vīrusu slodze, tāpēc šis mutants var būt arī patogēnāks.
2. attēls. Genoma mutāciju secība, kas ietverta Lielbritānijas koronavīrusa mutanta celmā B.1.1.7.
3. attēls. N501Y mutācija notika gan Lielbritānijā, gan DienvidāfrikāVarianti
Chuangkun Biotech Inc. ir veiksmīgi izstrādājis noteikšanas komplektu B.1.1.7 un 501Y-V2 jauniem koronavīrusu variantiem.
Šis komplekts var vienlaicīgi noteikt N501Y, HV69-70DEL, E484K mutāciju vietas un jauno koronavīrusa S gēnu;Ātra pārbaude: rezultāts prasa tikai 1 stundu 30 minūtes no parauga savākšanas.
4. attēls. COVID-19 Lielbritānijas varianta pastiprināšanas līknes noteikšana
5. attēls. COVID-19 Dienvidāfrikas variantu pastiprināšanas līknes noteikšana
6. attēls. Jaunās koronavīrusa pastiprināšanas līknes savvaļas tips
Nav skaidrs, kā šīs mutācijas uzkrāj jaunu pandēmijas kovīda-19 ilgtermiņa ietekmi.Bet tas mums atgādina, ka šīs mutācijas var ietekmēt dabiskās imunitātes un imunitātes efektivitāti, ko izraisa vakcinācija.
Pasta laiks: 2012.-1221. Marks